安徽医学高档专科学堂工会，全称为安徽医学高档专科学堂工会委员会。校工会是在学堂党委和上级工会辅导下发展工作的人民组织。学堂工会委员会现由14人组成，设有工会主席1人，工会干事1人。截止2024年10月31日，学堂现有在职教职工会员580余人，由机关一分工会、机关二分工会、公共基础学院分工会、基础医学院分工会、马克思主义学院分工会、临床医学院（全科医学院）分工会、口腔医学院（从属口腔医院）分工会、医学技术学院分工会、护理学院分工会、公共卫生与健全治理学院分工会、药学院分工会共11个二级单元分工会组成。
在学堂党委和省卫健委直属机关工会的辅导下，校工会当真推广工会“守护、教育、参加、建设”四项社会职能，紧紧萦绕学堂的中心工作，全力守护宽大教职工的合法权利，致力把工会办成宽大教职工会员酷爱的“职工之家”。近年来，校工会积极发展丰硕多彩、大局多样的教职工文体活动，先后荣获“安徽省教科文卫体系统工会工作先进集体”“中国好男儿安徽省大学生篮球赛暨第四届安徽省校长杯高校教职工篮球赛第六名”“安徽省直机关保龄球角逐男子集体赛第五名”等荣誉。
校工会将深刻进建贯彻党的二十届三中全会心灵，与时俱进，启发创新，不休加强自身建设，积极索求新时期做好高校工会工作的新思路、新蹊径，充分调动和阐扬宽大教职工的积极性、创造性，联结奋进谋发展、凝心聚力谱新篇，为实现学堂高质量逾越式发展做出更大的贡献。
